(Đọc bài dưới thì rất dài, nhưng nói chung cũng chỉ là trả lời câu hỏi ví dụ như khi cài lại win nó hỏi chọn loại nào thì nên chọn FAT hay NTFS. Câu trả lời là NTFS mới hơn và ưu việt hơn và bảo mật tốt hơn, nên chọn NTFS )

Một số kiến thức cơ bản về FAT32 và NTFS

Trước khi cài đặt, Windows XP luôn đòi hỏi format lại đĩa cứng theo định dạng FAT32 hoặc NTFS. Sử dụng các chương trình format đời mới hiện nay nó cũng đưa ra lựa chọn giữa FAT32 và NTFS. Vậy hệ thống FAT32 và NTFS trên đĩa cứng là gì, tác dụng của nó thế nào, nên chọn loại nào cho máy tính?

Khái niệm về FAT và NTFS

FAT16: Với HĐH MS-DOS, hệ thống tập tin FAT (FAT16 – để phân biệt với FAT32) được công bố vào năm 1981 đưa ra một cách thức mới về việc tổ chức và quản lý tập tin trên đĩa cứng, đĩa mềm. Tuy nhiên, khi dung lượng đĩa cứng ngày càng tăng nhanh, FAT16 đã bộc lộ nhiều hạn chế. Với không gian địa chỉ 16 bit, FAT16 chỉ hỗ trợ đến 65.536 liên cung (clusters) trên một partition, gây ra sự lãng phí dung lượng đáng kể (đến 50% dung lượng đối với những ổ đĩa cứng trên 2 GB).

FAT32: được giới thiệu trong phiên bản Windows 95 Service Pack 2 (OSR 2), được xem là phiên bản mở rộng của FAT16. Do sử dụng không gian địa chỉ 32 bit nên FAT32 hỗ trợ nhiều cluster trên một partition hơn, do vậy không gian đĩa cứng được tận dụng nhiều hơn. Ngoài ra với khả năng hỗ trợ kích thước của phân vùng từ 2GB lên 2TB và chiều dài tối đa của tên tập tin được mở rộng đến 255 ký tự đã làm cho FAT16 nhanh chóng bị lãng quên. Tuy nhiên, nhược điểm của FAT32 là tính bảo mật và khả năng chịu lỗi (Fault Tolerance) không cao.

NTFS (New Technology File System): được giới thiệu cùng với phiên bản Windows NT đầu tiên (phiên bản này cũng hỗ trợ FAT32). Với không gian địa chỉ 64 bit, khả năng thay đổi kích thước của cluster độc lập với dung lượng đĩa cứng, NTFS hầu như đã loại trừ được những hạn chế về số cluster, kích thước tối đa của tập tin trên một phân vùng đĩa cứng.

NTFS sử dụng bảng quản lý tập tin MFT (Master File Table) thay cho bảng FAT quen thuộc nhằm tăng cường khả năng lưu trữ, tính bảo mật cho tập tin và thư mục, khả năng mã hóa dữ liệu đến từng tập tin. Ngoài ra, NTFS có khả năng chịu lỗi cao, cho phép người dùng đóng một ứng dụng “chết” (not responding) mà không làm ảnh hưởng đến những ứng dụng khác. Tuy nhiên, NTFS lại không thích hợp với những ổ đĩa có dung lượng thấp (dưới 400 MB) và không sử dụng được trên đĩa mềm.

So sánh giữa FAT32 và NTFS

NTFS là hệ thống file tiên tiến hơn rất nhiều so với FAT32. Nó có đầy đủ các đặc tính của hệ thống file hiện đại và FAT32 không hề có. Bạn nên dùng NTFS để thay thế cho FAT32 vì các lý do sau:

- FAT32 không hỗ trợ các tính năng bảo mật như phần quyền quản lý, mã hoá.. như NTFS. Vấn đề này đặc biệt hiệu quả đối với Windows. Với NTFS, bạn có thể không cần sử dụng các tiện ích mã hoá hay đặt mật khẩu giấu thư mục v.v, vì đây là đặc tính đã có sẵn của NTFS, chỉ cần bạn biết khai thác. Việc xài các tiện ích không nằm sẵn trong hệ điều hành để thao tác trực tiếp với đĩa vẫn có ít nhiều rủi ro.

- FAT32 có khả năng phục hồi và chịu lỗi rất kém so với NTFS. Có một số ý kiến cho rằng NTFS không tương thích nhiều với các chương trình kiểm tra đĩa hay sửa đĩa mà người dùng đã quen thuộc từ lâu, như vậy sẽ vô cùng bất tiên trong trường hợp đĩa bị hư sector. Nên yên tâm vì NTFS là hệ thống file có khả năng ghi lại được các hoạt động mà hệ điều hành đã và đang thao tác trên dữ liệu, nó có khả năng xác định được ngay những file bị sự cố mà không cần phải quét lại toàn bộ hệ thống file, giúp quá trình phục hồi dữ liệu trở nên tin cậy và nhanh chóng hơn. Đây là ưu điểm mà FAT 32 hoàn toàn không có.

Khi mà mất điện đột ngột thì Windows 98, 2000, XP… đều phải quét lại đĩa khi khởi động lại nếu đĩa đó được format bằng chuẩn FAT32. Trong khi format đĩa cứng bằng NTFS thì lại hoàn toàn không cần quét đĩa lại, bởi vì hệ thống dùng NTFS có được những thông tin về tính toàn vẹn dữ liệu ghi trên đĩa và nó mất rất ít thời gian để biết được về mặt logic đĩa của mình có lỗi hay không và nếu có thì hệ thống cũng tự phục hồi một cách cực kỳ đơn giản và nhanh chóng. Với FAT32 thì nó phải rà quét toàn bộ lâu hơn nhiều. Một hệ thống Windows 2000, XP sẽ ổn định hơn nhiều nếu cài trên phân vùng được format bằng NTFS. Ngoài ra NTFS còn được trang bị công cụ kiểm tra và sửa đĩa rất tốt của Microsoft.

- NTFS có khả năng truy cập và xử lý file nén ngon lành hệt như truy cập vào các file chưa nén, điều này không chỉ tiết kiệm được đĩa cứng mà còn gia tăng được tuổi thọ của đĩa cứng.

- Nhiều người phàn nàn rằng không thể truy cập vào các đĩa cứng được format bằng NTFS khi đang ở DOS, Windows 98 hoặc WinME… Thực ra thì DOS, Windows 98 và Windows ME đã quá cũ và các phần mềm còn hữu dụng của chúng cũng không còn bao nhiêu.

- NTFS đặt được quota sử dụng cho người dùng, vô cùng tiện dụng cho các hệ thống máy ở công ty. Đặc biệt tiện dụng khi “âm thầm” cấm được con cái sao chép những phim ảnh độc hại vào các thư mục “bí mật” của chúng trong đĩa cứng.

Ngoài ra, NTFS còn có rất nhiều tiện ích tuyệt chiêu chuyên sâu khác cho giới người dùng cao cấp khác như “mount partition”, tạo “hard link” tới một file, hỗ trợ dùng RAID v.v

- Nếu bạn đã thực sự quyết định chọn NTFS làm “duyên giai ngẫu” thì bạn có thể từ bỏ hẳn FAT 32 kể từ nay. Hiện có rất nhiều tiện ích chuyển đổi từ FAT 32 sang NTFS tùy bạn lựa chọn. Tiện hơn cả là dùng bộ tiện ích có sẵn trong các đĩa CD khởi động bằng Hirenboot đang rất phổ biến hiện nay.

Tuy thế, FAT32 vẫn còn tỏ ra hữu dụng trên các máy tính cấu hình quá yếu ớt, chỉ có thể chạy được Windows 98. FAT16 và FAT32 vẫn được dùng để định dạng cho các loại thẻ nhớ, vì các thiết bị chấp nhận thẻ nhớ như máy ảnh số, máy nghe nhạc vẫn chưa thấy loại nào tương thích với NTFS cả. FAT16 luôn là lựa chọn hàng đầu khi bạn muốn copy dữ liệu của mình từ một máy tính chạy Windows sang máy chạy hệ điều hành khác như Mac chẳng hạn. Hầu hết các máy Mac hiện nay đều không thể nhận dạng các thẻ nhớ USB được định dạng bằng FAT 32.

Ngoài ra FAT32 chỉ chấp nhận file có kích thước tối đa 4Gb, còn NTFS cao hơn nhiều.
Vậy là bạn đã quyết định được nên xài định dạng nào rồi chứ?
SOURCE 

Cách chuyển đổi từ FAT sang NTFS mà không bị mất dữ liệu

Bình thường khi dow game hay film các bạn sẽ gặp tình trạng ổ cứng ghi là thiếu dung lượng trong khi vẫn còn thừa hoặc ko nhận các file lớn hơn 4G,cách này sẽ giúp các bạn chuyển đổi từ định dạng FAT32 sang NTFS dễ dàng mà ko cần dùng phần mềm,rất đơn giản,mình đã test mà 100% ok,có gì thắc mắc cứ hỏi,mình sẽ giải đáp(mà làm đúng chắc chắn được nhé^^!)
Trong phiên bản Windows NT, XP, Microsoft đã tích hợp công cụ Command Prompt để giúp bạn dễ dàng chuyển đổi định dạng bản đĩa từ fat32 sang ntfs mà không phải lo lắng về những gì chứa trong đó.
Để chuyển đổi từ FAT32 sang NTFS, ta thực hiện theo các bước sau:

a) Vào Command Prompt: (Start -> All Programs -> Accessories -> Command Prompt. )
* Bạn có thể vào nhanh Command Prompt bằng cách gõ cmd vào hộp thoại run (Click Start chọn Run)
 
b) Tại cửa sổ soạn thảo của Command Prompt, gõ chính xác dòng lệnh dưới đây
CONVERT X: /fs:ntfs “không phân biệt chữ hoa, thường” rồi gõ enter. Với X là tên ổ đĩa bạn muốn chuyển. Ví dụ bạn muốn chuyển ổ D thì gõ: convert d: /fs:ntfs
 
c) Một bản thông báo với nội dung: type the volume label of the drive that you are converting, and then press ENTER: nhập volume label ( nhãn) của ổ đĩa bạn muốn chuyển đổi và nhấn enter. Bạn hãy gõ label của ổ đĩa đó ví dụ máy tôi ổ đĩa D là DATA (D: ) tôi sẽ gõ data rồi enter.
 
d) Lúc này hệ thống sẽ tiến hành chuyển đổi và bạn phải đợi trong ít phút. Sau khi chuyển đổi xong, bạn sẽ nhận được bản thông báo sau:
Conversion complete
 
e) Đóng command prompt lại bằng cách gõ lệnh exit trong cửa sổ Command Prompt (không phân biệt chữ hoa, thường) và nhấn Enter.
 
f) lúc này bạn hãy mở my computer chọn ổ đĩa mà bạn đã chuyển đổi rồi nhấn alt+enter để vào Properties và dùng JAWS cursor để rà bạn sẽ thấy file system bây giờ là File system: NTFS chứ không phải là File system: FAT32 như trước kia.
 
*Các bạn là người sáng mắt click phải lên ổ đĩa vừa được chuyển đổi định dạng rồi chọn Properties
 
Lưu ý:
1) Nếu ổ đĩa bạn chuyển đổi từ FAT32 sang NTFS là ổ đĩa chứa hệ điều hành đang thực thi, bạn phải khởi động lại máy thì hệ thống mới thay đổi vì hệ thống không thể chuyển đổi trong khi hệ điều hành đang hoạt động. nếu bạn chấp nhận, bạn chọn “yes”
 
2) Bạn không thể chuyển đổi với công thức trên từ NTFS sang FAT32.
để chuyển đổi từ NTFS sang FAT32, bạn phải chuyển toàn bộ dữ liệu của ổ đĩa bạn muốn chuyển đổi sang một ổ đĩa khác rồi re-format ( định dạng lại)ổ đĩa bạn muốn chuyển đổi từ NTFS sang FAT32 và sau đó copy dữ liệu trở lại.
*Hiện nay có một số phần mềm như Partition Magic, Partition Manager cho phép ta chuyển định dạng đĩa NTFS thành Fat32 mà không cần copy dữ liệu
 
3) FAT12 chỉ sử dụng cho ổ đĩa A

Giải quyết một số lỗi gặp phải

1) Khi bạn đang nỗ lực chuyển đổi từ FAT32 sang NTFS nếu bạn gặp bản thông báo:
Convert cannot gain exclusive access to the drive letter drive, so it cannot convert it now. Would you like to schedule it to be converted the next time the system restarts?

Vấn đề này cho biết dữ liệu trong ổ đĩa bạn chuyển đổi đang được thực thi bởi một ứng dụng hay một máy khác từ hệ thống mạng nội bộ. để giải quyết vấn đề này, bạn có thể thực hiện theo một trong các bước sau:
Tắt tất cả các ứng dụng đang chạy file có trên đĩa mà bạn chuyển đổi rồi nhấn Y để command Prompt tiến hành chuyển đổi. Tại Command Prompt, nhấn Y và Enter

2) Khi bạn đang nỗ lực chuyển đổi từ FAT32 sang NTFS nếu bạn gặp bản thông báo:
Convert cannot gain exclusive access to the drive letter drive, so it cannot convert it now. Would you like to schedule it to be converted the next time the system restarts? 
Nhấn Y tại Command Prompt và nhấn Enter. Hệ thống sẽ chuyển đổi sang NTFS sau khi bạn khởi động lại máy.
*Y, N tượng trưng cho Yes, No

Tham khảo

Để tham khảo thêm về chuyển đổi từ FAT32 sang NTFS xin vui lòng:
Nhấn: Start -> All Programs -> Accessories -> Command Prompt
Tại Command Prompt, gõ chính xác lệnh: “help convert”
Mọi thông tin bằng tiếng anh sẽ thỏa mãn yêu cầu của bạn.
*Bạn cũng có thể gõ: "convert /?" để xem các thông tin về convert  
SOURCe